«Το έργο της ανέγερσης του νέου Μουσείου περιλαμβάνεται στον προγραμματισμό του Υπουργείου Πολιτισμού (ΥΠ.ΠΟ.) για το ΕΣΠΑ, υπό την προϋπόθεση ότι το έργο διαθέτει την απαραίτητη ωριμότητα (εγκεκριμένη οριστική μελέτη). Το ΥΠ.ΠΟ. προτίθεται να το προωθήσει προς ένταξη στο Επιχειρηματικό Πρόγραμμα «Ανταγωνιστικότητα Επιχειρηματικότητα 2007 – 2013».
Παράλληλα ο κ. Σαμαράς αναφέρει πως «η χρηματοδότηση της μελέτης του έργου της ανέγερσης του νέου Αρχαιολογικού Μουσείου Χανίων δεν έχει ενταχθεί σε Κοινοτικό Πρόγραμμα, διότι πληρώνεται ήδη από εθνικούς πόρους (ΣΑΜ 014), οπότε θα υπήρχε θέμα επιλεξιμότητας της σχετικής δαπάνης» και πως «η αποπληρωμή της μελέτης θα γίνει επίσης από εθνικούς πόρους.
Υπενθυμίζεται πως την Άνοιξη του 2007, ο πρώην υπουργός Πολιτισμού κ. Γ. Βουλγαράκης, δήλωνε από τα Χανιά, για το νέο αρχαιολογικό μουσείο Χανίων πως:
«Η μελέτη για το νέο Μουσείο Χανίων έχει ήδη ανατεθεί και εκπονείται με χρηματοδότηση από εθνικούς πόρους του ΥΠ.ΠΟ., ύψους 1,2 εκατ. €. Προβλέπεται ότι θα ολοκληρωθεί το Σεπτέμβριο του 2007. Θα ακολουθήσει η δημοπράτηση της εργολαβίας κατασκευής του έργου, με εκτιμώμενο προϋπολογισμό 12 εκατ. €, με χρηματοδότηση από το Δ’ ΚΠΣ και χρόνο ολοκλήρωσης των εργασιών 1,5 έτος περίπου. Επιπλέον, από το Δ’ ΚΠΣ, θα χρηματοδοτηθεί και η υλοποίηση της έκθεσης στο Μουσείο, με προϋπολογισμό 1,5 εκατ. €, και διάρκεια υλοποίησης 1,5 χρόνο περίπου. Σε κάθε περίπτωση, ο προγραμματισμός των εργασιών θα είναι τέτοιος, ώστε η παράδοση των αιθουσών στο κοινό να είναι σταδιακή».
